De strategie van Greenport Nederland is gebaseerd op het opereren vanuit gezamenlijke belangen: vanuit het bedrijfsleven, belangenorganisaties en vanuit de locale, provinciale en landelijke overheid.  

Door een netwerkstructuur worden de ontwikkelingen van vijf kernen (greenports) en de verbonden overige productielocaties in de glastuinbouw, boom- en bollenteelt (satellietgebieden) met elkaar verbonden.

Greenport Nederland heeft samenhang en commitment in een gezamenlijke strategische agenda mainport gebracht met de volgende thema's:

• Gebiedsontwikkeling (ruimte, infrastructuur, logistiek, standaardisatie)
• Toegevoegde waarde (marktinnovatie en -versterking)
• Quality of life (duurzaam ondernemen & samenleving, arbeid en scholing)
• Mainport (internationalisering, Greenport University Network, mainportontwikkeling)

Vanuit deze agenda zorgt Greenport Nederland voor blijvend commitment bij overheden, bedrijfsleven en overige organisaties.

Er functioneert een Stuurgroep, die een aantal keer per jaar samenkomt en een faciliterende managementgroep.